想开发（或买）一套完全基于互联网的进销存管理软件，再加上一定的物流管理和财务管理的成本？

如果没有足够的实力，不能保证合作伙伴的持续性，最好不要采取这种方法。
采取这种方法，往往就意味着项目拖入了漫长的折腾之中，搞两年扔掉。
完全基于互联网的B/S结构的进销存软件，北京有家企业在做，用.net开发的，但名气不大。
用友有套高端NC-ERP，有财务、供应链，功能非常强。但价格也够高。不过，这套软件还是比较适合你们公司的。与其省钱却不成功，不如找一个合适的产品。
还有一种模式就是采用现在非常成熟的C/S结构的管理软件，例如用友、金蝶。分公司采用远程接入或者VPN的方式来解决，需要增加硬件投资。