企业两年不年检的法律后果

1、没收期间所有非法所得
2、罚款
3、甚至可以吊销营业执照，注销公司

国家工商总局2014年2月19日发出通知，自3月1日起正式停止企业年度检验制度，要求各级工商机关抓紧做好企业年度报告公示制度等一系列新制度的实施准备工作。此举意味企业工商年检制度将正式告别历史舞台。根据国务院新近出台的《注册资本登记制度改革方案》，企业年度报告公示制度正式取代企业年检制度。
企业按年度在规定的期限内，通过商事主体登记及信用信息公示平台，向登记机关提交年度报告并向社会公示，由企业自己对年度报告的真实性、合法性负责。年度报告包括公司股东（发起人）缴纳出资情况、资产状况等，企业须对年度报告的真实性、合法性负责，工商部门可以对企业年度报告公示内容进行抽查。经检查发现企业年度报告隐瞒真实情况、弄虚作假的，工商部门依法予以处罚，并将企业法定代表人、负责人等信息通报公安、财政、海关、税务等有关部门。企业三年不进行年报，将被永久列入“黑名单”。

这样企业会被吊销营业执照。
股东有义务组织清算原公司债权债务，资不抵债的可申请破产。