我们要求我们的客户修改信用证，费用由我们来出，怎么操作？

是的，你说的没错。
客户那边直接跟开证行说明，到时你收到amendment时，就会看到有显示：the amending charge is paid by beneficiary 的条款。
你不用担心，只需向客户确认修改了没有。等待通知行通知你们收到修改件就好了。

按国际贸易惯例L/C修改费用是由开证申请人承担的！