请问通过高考考上的大学毕业后取得的毕业证与通过自考考上的大学的毕业证有什么不同呢？

没有什么不同，只不过高考上的大学，学习的过程更系统一些，会有一些选修课，而自考只是相对于专业比较集中而已。

自考盖的是主考院校的章和自考委的章,而普通大学盖的是所在大学的章和校长名章

你是说毕业证书的作用,还是本本的内容

一般来说高考后上大学取得的毕业证比自考上大学的含金量大，社会认可度高。