已扣缴个人所得税的工资总额能不能全额进入营业成本

要把税金包含进去，税金是个人所得税，和企业无关的。还要区别员工的工作种类（如生产员工、行政人员、销售人员等），不是所有员工的工资都是成本。有的归入费用。

应当将税前工资，即包含个人所得税在内的工资总额计入成本当中，不能只将税后工资计入。