为什么我c盘有windows和windows.0两个文件夹,而且两个都不让删除

因为你的系统安装了二次，第二次安装时没选择格式化后安装，按你原来的方法再装一次将会多出一个windows.1来。
要删除你得先确认你进的是哪一个系统，然后再删除另一个，是可以删除的，如果二个都提示文件使用中，你可以进安全模式把另一个干掉。