いらっしゃいますか

这是特殊变化，用的是『ら行五（四）段特别活用』，接『ます』以及『まし』『ませ』时固定用法『いらっしゃいます』。
区别于命令型的『いらっしゃい』，虽然写法一样但这里是连用型活用。因为『ます』是表示礼貌尊敬的助动词，属用言。
以上参考自三省堂大辞林

另外，学研国语字典也有如下解释：
「なさる」「おっしゃる」「いらっしゃる」「くださる」「ござる」などは、连用形が助动词「ます」に続くときは「-い」となる。
也就是说，不只这个词，「なさる」「おっしゃる」「いらっしゃる」「くださる」「ござる」连用型后续『ます』时，都是词尾变为『い』再接『ます』

いらっしゃり在应用过程中发生音变.演化成いらっしゃい

日语的变形也不是一味的按照规则的，就像有的英文一样也有特殊。
只要记住就可以了。

いらっしゃり在应用过程中发生音变.演化成いらっしゃい

いらっしゃい是特殊用法,而且他的原形就是自己本身啦...
敬语确实比较搞的...

因为它特殊，接ます时，前面要求是命令型いらっしゃい。