RT-PCR设计引物,如何找到目的基因的保守区?

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/05/16 00:57:57
询问比较具体的步骤,谢谢

引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。

个人感觉rt的primer自己设计很麻烦,何不去查一下你要p的基因是不是有人报道过可用的rtpcr的primer呢?
你可以去RTPrimerDB、Primer Bank等网站去看看有没有在database中登记过的primer,直接合成就可以用了。
找不到的话,可以搜搜你要p的基因的文献,看看method,如果他做过rt,一定会有primer的。

好运。