为什么当眼睛看到石子与目标重合时,石子落下来就会击中目标

因为光是沿直线传播的，当你瞄准后，眼睛-石头-目标就三点重合到一条直线上了，而石子做自由落体运动，是匀加速直线运动，所以会击中。
如果眼睛-石头-目标三个物体在水平直线上，那么，你就得算下了，这时，目标也会下降，目标下落需要的时间t，你平抛出的石子的水平速度因为石子和目标距离与t的商。
你说的应该是第一种情况吧！

光的直线传播；（用于准直）

我可以很负责任的告诉你：不一定！
只有当眼睛-石子-目标所在的直线和重力所指的方向一致的时候石子落下来才会击中目标。
如果你把眼睛-石子-月亮一条线，石头是不会击中月亮的……

不一定

水平直线和石头抛物线的交点不一定正好是目标