求教增值税问题

首先,你公司在是在误操作的前提下导致这两张发票作废的,应该在发现误操作的第一时间通知收票单位,要求马上退回抵扣联和记帐联,这样就不会存在你上面说的那么多麻烦事了.
其次,现在事情已经发展到这一步,你公司唯一能够做的是打报告到本地税务局,将事实陈述清楚,请求税务机关酌情考虑出现的情况:1、虽然我公司误操作将发票作废，但是后面还是按大厅领导的要求申报了该笔销项税，国家没有受到损失；2、受票方虽然将收到的发票在网上认证，但是最终也没有抵扣进项税，对国家来说还是没有损失；3、必须陈述工作上的失误那是在所难免的，但是工作失误不是公司主观意愿的表现，公司没有偷税漏税的动机，同时可以陈述公司近几年的纳税的良好记录等等。
再次，需要与税务机关的负责人有一个良好的“沟通”，除了公司递交的报告以外，你们还得让税务领导们肯为你开这个先例，让他们玩得高兴点，不仅这次的事情处理好了，以后有什么问题都好说了。哈哈。
就这么多吧，希望对你有所帮助。

晕。
仅供参考：
1，先让对方到他的税务那，对3月两张没做抵扣的发票作出书面证明。
2，重新开10月份跟上两张一模一样的增值税专用发票。
3，国税局不会给你退，但可以给你出证明这两张发票才是扣3万依据。
你必须先跟你的国税专管员沟通，他会告诉你如何操作。

目前没有办法。找税务局或许还有一线希望。
这么严重的问题为什么到现在才想起来解决，在90天内可以有办法解决。发现问题要及时解决，不要拖，延误了解决的好时机。
会计同志们：在工作中一定要认真仔细，出现问题不可怕，可怕的是隐瞒、拖延。我们在百度回答问题就是要帮助大家解决问题，提高专业技术水平。

你那30000元算是白交了，目前就你所遇到的这种情况，国税总局也没有研究出解决办法。

你就是悬赏10000分，我也帮不了你的忙。

开票系统太不完善了，
如果系统可以设置（作废了就不能认证，
认证了就不能作废，就没这种事了，）
软件不好，

一般误作废的发票，销方按整票报税后，购方可以抵扣。
像你们这种情况没办法了，要回原发票重开一张吧。起码不用扣你们的货款。