请高手给解答：实际工作中的问题，既交增值税又交营业税

1、在地税代开运输发票，地税已代扣代缴所得税，以后在国税就不用再交所得税了。也就是说所得税不管是被代扣代缴还是申报缴纳，只能用一个标准来衡量计税。
2、混合经营一定要分别核算，否则全都征增值税。
3、
采石成本：人工工资、设备折旧、油料消耗等。
运输成本：车辆折旧、人工工资、油料消耗、车辆修理、车辆通行费用、税金。

补充：
1、关于地税代开运输发票的问题，地税代开时已代征了营业税、城建税、教育费附加、地方教育附加费、企业所得税。
这个地税代征的所得税，国税是承认的，对于地税代开发票这部分运输收入，就不必再向国税申报缴纳的企业所得税了。
这种情况我也碰到过，国税专管员也不希望地税代征所得税，但是地税征了，国税也没有办法，也得承认地税已代征的所得税。不管你单位是核定的，还是查账的，这部分都不用申报缴纳所得税。
你平时申报所得税，把卖石头的收入申报就可以了。运输收入，不用申报。把完税凭证复印留存，到年终汇算清缴时，国税专管员要看的。
2、建议将运输收入和与运输相关的成本费用和税金，计入“其他业务收入”和“其他业务支出”，这样实用方便。一定要单独核算卖石头收入和运输收入。
3、对于代开运输发票收入，每月还要向地税申报“印花税”；每季要申报防洪保安等费。

回答问题1:
你企业的企业所得税是以什么方式征收的?查账征收还是核定征收?
如果是查账征收(大多数企业是这样的),应该是企业每季度末按照收入、成本、费用账算出应纳税所得额，计算应交所得税，向主管税务机关申报、缴纳。
既然在国税缴纳所得税,即主管税务机关是国税局，怎么又在地税交?地税以什么理由收取?
如果地税真的收了,那么国税当然要认可。因为都是依照《中华人民共和国所得税法》缴纳的，交到中华人民共和国国库里了。
企业分支机构在异地交的所得税，总机构在汇总计算时，还要作为已交部分冲减。
回答问题2：
从两项收入占的比重来看，70％的运输收入更应该作为主营业务收入。当然，两者应均作为主营业务收入，但一定要单独核算，即在主营业务收入科目下设二级科目：
－－销售收入
－－