去马来西亚的新山，我想直接飞新加坡然后陆路过境到马来，只持有马来签证可以吗？

不可以，你应该先声请新加坡的签证，再去JB。
从新加坡去JB会比飞吉隆坡再去近很多啦

新加坡没有落地签证，也没有过境签证，因此你在新加坡去新山，必须办理新加坡签证，否则不给予你入境。

肯定不可以的！你一定需入境新加坡才能陆路去新山的。

不过在新加坡只是过境的话（飞机）那没问题，陆路可能就不可以了

应该不可以。除非你从新加坡直接转机到新山。