酶 从微观角度上讲是怎么降低活化能的？

举例来说：
A、B、C 三种分子，A+B=C，催化剂：酶E
本来是 A、B 直接反应，活化能很高，

现在是——
A + E = A-E，这一步活化能可以很低，
A-E + B = A-E-B，这一步活化能可以比较低，
A-E-B = C + E，这一步活化能可以很低。

整个过程就是 A + E + B = C + E
每一步的活化能都不高，因此降低了活化能。
（三步的活化能是不用相加的。）

所谓微观机理，不知道你要多深的解释？
简单的解释，就是上面的几个反应，A-E-B 叫做活化络合物，
是一种半分离状态的分子复合体，它是许多催化剂降低活化能的关键。

复杂的解释，就是分子反应动力学计算，利用量子化学的办法，
可以计算出所有可能性较高的反应通道，其中 A-E-B 复合体的能量
必然是反应势能曲面上的鞍点，也就是可能性最大的反应通道的中间点。