我2007年1月1日与公司签订两年至2008年12月31日到期

公司的补偿方案完全合法。
劳动合同法规定在2008.1.1之后存续的劳动合同，经济补偿期限按照2008.1.1起算起到劳动合同到期日止。2008.1.1前的实际工龄按照2008.1.1前的有关法律规定执行，而2008.1.1前没有法律规定因劳动合同期满用人单位不续签需要支付经济补偿金，所以用人单位不必支付劳动者2008.1.1前的工龄的经济补偿金。

劳动合同法：
第九十七条 本法施行前已依法订立且在本法施行之日存续的劳动合同，继续履行；本法第十四条第二款第三项规定连续订立固定期限劳动合同的次数，自本法施行后续订固定期限劳动合同时开始计算。
本法施行前已建立劳动关系，尚未订立书面劳动合同的，应当自本法施行之日起一个月内订立。
本法施行之日存续的劳动合同在本法施行后解除或者终止，依照本法第四十六条规定应当支付经济补偿的，经济补偿年限自本法施行之日起计算；本法施行前按照当时有关规定，用人单位应当向劳动者支付经济补偿的，按照当时有关规定执行。
第九十八条 本法自2008年1月1日起施行。