税务要来检查，在来之前补交增值税可以吗？

根据实体法从旧，程序法从新的原则，你现在补交税款，应按税款所属年度的税率缴纳，而不是你实际缴纳税款年度的税率缴纳。
所以，你补交以前年度税款，只能按4%的税率计算缴纳增值税款。

一般来说，自己主动补交，不会被处罚，但是需要补交税款和滞纳金（滞纳金为每天万分之五）。

需要补交税款的,但同时要交滞纳金.

小规模纳税人税率由4%降为3%是从09年1月1日开始的。

你们是属于帐户没钱不是逃税不回罚款。

以后注意纳税帐户余额

补缴，一般不会罚款，收滞纳金。小规模纳税人税率由4%降为3%是从2009年1月1日起实行。