软件著作权问题疑问

软件著作是不是只有向有关机构申请了才有的。我是软件开发人员，最近开发了一套产品，著作权如果我不申请，在合同上声明了软件的著作权归我，那么如果发生纠纷了我再申请可以吗，所有软件代码只有我自己有。

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