C语言查找字符串并报道其在字符串中的位置

各位牛人：
小弟有个问题想向你们请教，能否帮忙解决一下？
是这样的有一个有ATGC组成的DNA序列：AAATAAATAAATAAATTTGCGATATATATATCGCGCGTAGGTAGGTAGGTAGGCGATTTCGATTTCGATTTCGATTTCGATTT
我们能很容易的看到序列内部有许多重复序列，AAATAAATAAAT,AAA,TTT,ATATATAT,CGCGCG,TAGGTAGGTAGGTAGG,CGATTTCGATTTCGATTTCGATTTCGATTT
我要问的问题是：如何在一个任意的DNA序列内部识别这些重复，并且以最大匹配的方式识别这些重复，例如重复AAATAAATAAAT, 而并不被看成是AAA,并且报告它们在序列中的位置，

用c语言编写一个程序,用于接收一个字符串,并统计某字符在该 字符串中出现的次数 c语言：字符串变量和字符数组 c语言，提取字符串中的字符 编写一个C函数,查找字符串中的子字符串,并返回这个字符串在原串中的起始位置. C语言指针问题:编写output函数,使其实现输出字符串左起奇数位上的字符 C语言编程：输入一个字符串，并删掉一个指定的字符。如输入JIGHH，删掉H C语言__数组中的查找某一元素,并显示其下标号!急!求高手! 在C语言中,字符数组能不能接受中间带空格的字符串 在C语言中 怎么讲单个的一个字符转换成字符串 用C语言编程 将字符串中的所有数字字符移到所有非数字字符之后，并保持原有的先后次序