请问若开出空头支票通知书后在银行会有不良记录吗

根据《中国人民银行关于对签发空头支票行为实施行政处罚有关问题的通知》(以下简称《通知》)，规定人民银行及其分支机构对签发空头支票的违规行为实施行政处罚。《通知》规定：
一是规定对空头支票违规行为实施行政处罚。《通知》明确实施空头支票行政处罚的主体为中国人民银行及其分支机构；处罚依据和标准为《票据管理实施办法》第三十一条“签发空头支票或者签发与其预留的签章不符的支票，不以骗取财物为目的的，由中国人民银行处以票面金额5%但不低于1000元的罚款”的规定；《通知》明确空头支票的罚款，由出票人在规定期限内到指定的罚款代收机构主动缴纳，逾期不缴纳的，人民银行及其分支机构可采取每日按罚款数额的3%加处罚款、要求银行停止其签发支票、申请人民法院强制执行等措施。
二是建立了空头支票违规行为的“黑名单”制度。为了加大对空头支票监管的力度，人民银行分支行建立签发空头支票“黑名单”制度，并将有关违规信息定期向同一票据交换区域内的银行进行通报。

因此，不但要进入“黑名单”，而且会被处以票面金额5%但不低于1000元的罚款。

处理就是：
1.记录在黑名单里
2.处以票面金额5%但不低于1000元的罚款
3.如果在次发生 停止签发支票的权利

以骗取财物为目的的 要追究刑事责任