哪个部门有权在公路上截查行驶中的汽车

交警，几乎所有的车都可以截查，军车、警车除外。主要查车子是否合法行驶。可以扣驾驶证、行驶证。

运政，可以截查营运车辆，检查是否有合格的营运资格。可以扣营运证。

刑警、治安警，可以截查所有车辆，通常是刑事调查或抓捕。可以扣人或身份证。

卫生防疫，截查运输鲜活农产品运输车辆，主要检查是否有检疫证，防止把病死动物运输。可以扣检疫证，并把货物销毁。

路政，可以截查明显超限运输的车辆，军警车、邮政车除外。可以扣营运证或公路部门颁发的任何证件。

海关，可以截查任何车辆，军警车、邮政车除外，主要检查是否有走私货物，可以扣人、扣车、扣货。

林业，可以截查任何出入林区的车辆，军警车、邮政车除外，检查是否有非法盗运木材。可以扣货、扣人、扣车。

交警、运管、路政等都可以，他们都有国家法律法规或是地方的法律法规，但扣驾驶证只有交警才可以。

交警、运管、路政都会来找你麻烦。
路政管超载、运管、管养路费。
交警等级最高，只要你一上路他们什么都可以管到。
根据中华人民共和国《道路交通安全法》交通 相关法则法规

正常情况下只有巡警，运管才可以，但其它情况，其它行政管理部门也可以，视你情况而定，不能一概论之