劳动合同解除中的问题

我是去年大学毕业来农四师工作的。在学校的兵团招聘会上和农四师签了一年的就业协议。是今年7月到期。来伊犁后。我本风道团场工作。在团场有和团场签了一年的劳动合同。可是其中规定了6个月的试用期，实习期在4月底结束。我打算在实习期结束后辞职。请问在那个时候辞职，我应该怎么做。需要交违约经吗？我的档案现在在团场，辞职后能不能拿到？
问题补充：就业协议书是毕业的时候，学校发的，也当时找到的单位签订的。就业协议书是毕业的时候，学校发的，与当时找到的单位签订的。 我来团场的第一个月就缴纳了月工资11%的养老保险和每月6块的大额医疗。今年团场又要求一次性交清全年12个月的养老和医疗保险费用。我一共交了1550块。在我申请辞职的时候，我是否可以拿回我交的那些钱。

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