等位基因的来源

没错 。等位基因是同源染色体上对应位置的控制相对性状的东西 而完全相同的基因控制的性状是相同的 这不是等位基因。 即等位基因必须是A和a的关系 ，a与a不算是等位基因只是相同基因。 而a的出现 是由于A发生了基因突变 从而等位基因都是由基因突变来的
同源染色体的交叉互换就是一对同源染色体的一段或几段等位基因 在靠得十分近的时候发生了断裂并重新连接形成互换

等位基因是位于一对同源染色体的相同位置上控制某一性状的不同形态的基因。不同的等位基因产生例如发色或血型等遗传特征的变化。等位基因控制相对性状的显隐性关系及遗传效应，可将等位基因区分为不同的类别。在个体中，等位基因的某个形式（显性的）可以比其他形式（隐性的）表达得多。

基因重组发生在减数第一次分裂时期，同源染色体发生分离，而非同源染色体自由组合。只有当同源染色体上有等位基因的时候重组才能出现不同的情况，而等位基因的产生正是由于基因突变的结果。

在生殖细胞形成时,一对同源染色体上的不同对等位基因之间可以发生交换,称为交换律或互换律。

连锁与互换规律 (law of linkage and crossing-over)
自由组合律主要针对非同源染色体上的非等位基因的遗传规律。但许多基因位于同一染色体上，这一现象称为基因连锁。 1909年美国遗传家摩尔根及其学生在孟德尔定律基础上，利用果蝇进行的杂交实验，揭示了位于同源染色体上不同座位的两对以上等位基因的遗传规律，即著名的连锁与互换规律。其基本内容是：生殖细胞形成过程中，位于同一染色体上的基因是连锁在一起，作为一个单位进行传递，称为连锁律。在生殖细胞形成时，一对同源染色体上的不同对等位基因之间可以发生交换，称为交换律或互换律。
连锁和互换是生物界的普遍现象，也是造成生物多样性的重要原因之一。一般而言，两对等位基因相距越远，发生交换的机会越大，即交换率越高；反之，相距越近，交换率越低。因此，交换率可用来反映同一染色体上两个基因之间的相对距离。以基因重组率为 1%时两个基因间的距离记作1厘摩（centimorgan，cM）。

从进化的角度
的确是突变来的～

从根本上来说等位基因是由基因突变来