我这几天发出了一批白铁皮，可是天下雨，在卸货的时候铁皮跟铁皮之间的水呈黄色，

这就是你的不对了，应该在货物上面遮盖塑料薄膜，防止雨水入浸。
运输金属，不论是黑色金属还是有色金属，规定都是要在运输过程中有覆盖物的，主要是怕氧化，即使没有下雨，空气潮湿也会影响用户对金属表面的要求。
这些黄水，不论是否是车厢板的锈水，还是本身的锈水，都污染了货物，所以，收货方如果有意见是有道理的。
你可以和对方协商，如果不影响使用或不影响再次销售，也许你没有什么损失，但是如果对方坚持要降价或者退货，你也只好如此，不知道你事先收了货款没有，如果没有，这生意你就要吃点亏了。

白铁皮没生锈，是装载的车厢生锈了吧