性激素在月经干净后第五天查

那要看检查的目的是什么了。
月经干净后5天，已经接近排卵期了，而月经开始的第三天，属于卵泡早期。
卵泡早期的检查能反映卵巢的基础分泌情况，是卵巢功能检查的最佳时间。如果检查卵巢功能，最好是在卵泡早期。如果监测卵泡生长和排卵情况，可以在卵泡中期和排卵期。
一般来说，任何时间的检查都有参考意义。

两次检查的结果会有比较大的差异。
首先雌激素水平会不同，如果观察不到不同，那说明卵泡没有发育，排卵不会发生。
再，黄体生成素会有差异，一般会上升一些，但不会太多。
还有FSH也会不同。这个内容就比较复杂，需要很长的篇幅说明了。