公司开的增值税发票被客户弄丢，发票是三月前开的，税已报了，客户却说发票不见了

你们有没有证据证明客户领取了发票？如果有，问题很简单，要求对方付款，丢失发票与你们无关，如果没有就不好办，因为现在说不清了，只能和客户协商，看是否可以用你们记账联的复印件加盖公章做为对方入账依据（税务局是认可这样操作的），当然进项税抵扣就不可能了。

不能再开发票给他,否则你们还要交一次税，而且帐务上也没法修理！
有一个办法，你向你的主管税务机关提出申报办理“已抄报税证明单”，办好之后连同记帐联复印件一起给客户，寻样他就能入帐了，不过如果他是不能再低扣了。

还有一点要记住，现在社会上淬一种说法：“记帐联加盖公章（也有说是财务专用章）可以和帐”，这种说法是错误的，税务检查时一旦发现立即罚款，因这前提条件是“还同已抄报税证明单一起入帐”，而已抄报税证明是由出票方主管税务机关出具的证明。

我以前在单位时接受到送货方来的发票都有一签字本的。双方责任明确。
付款方被可追朔。

也许对方说谎。