金门人和马祖人算是台湾人或是福建人了？

都可以

因为实际是福建人,
但因为目前台湾当局治理
您要说台湾人也可

金门群岛和马祖列岛都是中华民国的实际管辖区域.

目前中华民国实际管辖区域有台湾省和福建省的金门群岛与马祖列岛,还有东沙群岛和南沙群岛中的太平岛与中洲岛.

现在金门人和马祖人肯定都是属于台湾人。

金门和马祖目前都在台湾的管辖范围内...
至少他们并不是领中华人民共和国的身分证...

当地人肯定没有福建省的居民身份证的

金门县是中华民国福建省的一个县，全境位於中国福建省东南外海，现由中华民国政府实质管辖。1915年自福建省思明县分出，为福建省政府、福建高等法院金门分院驻地。
马祖原分别隶属於福建省连江县、长乐县与罗源县，现由中华民国福建省连江县管辖。中华人民共和国宣称拥有主权，将其划归福建省福州市连江县马祖乡，但无实际上之管辖。