怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析 详细点

将你需要比对的蛋白质序列选中，在BLAST界面Enter Query Sequence下面的大框中输入，如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对，再下面的Choose Search Set中选择你需要比对的数据库。Program Selection中的比对可根据个人需要进行选择

如果进行两两比对，或者多个序列的比对，在Enter Query Sequence框中选中Align two or more sequences，在弹出的框中，输入你需要比对的序列

最后点击BLAST即可。

结果得分越高，同源性越高，E值是期望值，得分越低同源性越高

将你要做的蛋白质序列弄上去，再点blast一下，就出来很多同源的了，分数越高的就越。。。