知识产权，原公司能告我吗？

可以起诉，起诉不需要理由，有诉讼请求就可以了。至于你公司能不能胜诉，那就要看你公司是不是享有著作权。你公司使用大量的第三方控件集成的软件，不确定是否享有著作权，这个要视具体情况而定。公司拖欠的工资可以通过在当地劳动部门申请劳动仲裁来解决。

起诉是绝对可以的！
这只是涉及民事诉讼法学上的“诉权”问题而已，可不可以起诉与能不能胜诉完全是两个概念。只要符合当事人适格、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实、理由属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖等《民事诉讼法》第108条的起诉条件，就可以对你进行起诉！
至于结果如何，究竟谁能胜诉，则要看双方举证情况，以及法庭表现等。你所说的情况涉及知识产权的相关问题，至于是否会认定为著作权还得相关主管部门进行鉴定。
最后，你说你会不会很麻烦，关于这个问题，我不好界定，也不知道你指的麻烦究竟是个怎样的概念。其实也不是特别麻烦，再者，他还拖欠你的工资，在你答辩的时候你还可以提起反诉，维护自己的合法权益，何乐而不为呢？

首先 你公司欠你的3000元钱 和你上面的案情无关。这但要明确。

对于你公司接收一套软件 这样软件的所有权在于 公司，那么 你用你公司的软件获利 属于不当得利。那么公司有权要回你获得的收益哦。但是 前提是 公司能够证明他们在取得这套软件前不知道这个款软件是盗版
具体情况 你应该去咨询 正规的法律机构
以上言论 不具有专业效力~！

不太可能告你

首先拖欠你3000元工资的事情和你这个事情是要分开的，不能混合在一起。第二；如果公司拥有此套软件所有权，那起诉你就可能胜诉。不然你不用害怕他起诉