我的电脑装的是Windows 98和Windows 2000双系统,这个问题应该如何解决？

这很简单啊,先制作一张Windows 98 的启动软盘，再用它启动你的计算机，运行sys命令恢复Windows 98引导记录后，再运行fdisk/mbr恢复主引导记录，完成后进入Windows 98，把winnt 和system volumn information 目录删除，再删掉C盘上的boot.ini、bootfont.bin、ntldr、nydetect.com、bootsect.dos文件就行了。