Linux的jdk版本有两种，分别是什么意思？

这跟java没关系
bin是二进制包，而rpm是redhat package 就是红帽的标准安装包，你信不信还有deb包，是debain的标准
区别就是rpm、deb安装的时候给你自动配置，一般都是lib安装到/usr/lib bin安装到/usr/bin下边，就算不是，在/usr/bin下也要建立一个软连接。
而二进制包你可以手动配置，初学者就不要用bin包了，bin包的安装方法
>./jdk-6u1-linux-i586.bin
看到许可协议，然后一直空格到许可协议末尾，按y，回车自动解压缩
然后还要配置export很麻烦，不会的话直接用rpm、deb包好了

bin是二进制包，而rpm是redhat package 就是红帽的标准安装包。
他们的区别就是rpm、deb安装的时候给你自动配置，一般都是lib安装到/usr/lib bin安装到/usr/bin下边，就算不是，在/usr/bin下也要建立一个软连接。
而二进制包你可以手动配置，初学者就不要用bin包了，bin包的安装方法
>./jdk-6u1-linux-i586.bin
看到许可协议，然后一直空格到许可协议末尾，按y，回车自动解压缩
然后还要配置export很麻烦，不会的话直接用rpm包好了

其实JDK装上用就行来，版本一样就行，看你写到这两个版本所一样到，jdk-6u1就知道了。
rpm表示是用rpm方法安装，可以在命令行用rpm -i XXX.rpm 安装，也可以在图形窗口双击安装，linux不是都自带了JDK了吗？还要装干吗

你说的两个版本是什么？一般来说是有一个default-jdk和open-jdk，只是不同的实现厂商，差异不大，建议选择open-jdk。