我是否应该交协议中规定的五千违约金？急！

违约金条款有效。
这五千元违约金约定的是你签定《就业协议》、承诺毕业后前往该学校任职。未履行就业协议、不按规定时间报到的话，就是违约，需要缴纳违约金。

楼主说的“已经规定没有违约金”，实际上是指劳动合同法颁布后，劳动合同中不得随意约定违约金。和《就业协议》两个概念。

简单地说，去该校报到、签订劳动合同后，带有5千违约金的《就业协议》就失效了。合同期内正常辞职即可（《劳动合同法》规定试用期辞职提前三天书面申请）。

我身边的人反正都交了。如果你觉得有问题，可以资讯当地的劳动或司法部门，寻求解释。

应该不生效！