我是05届毕业生，就业协议签了上海闸北区某单位，可报到证上的报到地址是湖州南浔，档案会寄到哪里去？

按你的说法，你应该是湖州的生源，毕业后到上海去工作。上海市目前落户比较困难，基本上都是签了协议后户口档案转回原籍，办理上海市工作居住证。因此，你的户口迁移证(应该也在你手里)、报到证和档案都会转回原籍，你直接去上海和单位签劳动合同即可。

不应该吧，报到证的地址应该与就业协议一致啊。不一致应该会给你寄到湖州吧。
祝好运。