晚上十点半从上海火车站能到东方明珠吗

可以的。
您可以乘坐轨道交通1号线 上海火车站站上车（往莘庄站末班车23:00），在人民广场站下车（运行时间：5分钟），换乘轨道交通2号线（往张江高科站末班车23:12），在陆家嘴站下车（运行时间6分钟）。