首套住房是商业贷款，正在还贷,我想买第二套住房用公积金贷款,给贷款吗

当然给贷款了 只是因为第二套住房的原因
你的首付要提高

住房公积金贷款的条件主要有三点:一是借款人必须有正式单位,信用较好,所在单位和借款人交纳了一年以上的住房公积金并能够继续交纳,同时申请人必须提供贷款担保:二是借款人是将贷款用于购买和建设房屋;三是要有房产产权证作抵押。
您这种情况，完全可以用公积金做贷款。
个人公积金贷款是目前利率最低的贷款，贷款的最高金额为40万元，各个地区的政策可能会有一些出入，但大体是相同的。

应该没问题的，只是利率上可能不会有太大优惠了