政府把党关系的档案丢了我应该去哪告她？

一、你是以偏概全哦！弄丢了你的党组织关系档案是个人行为，不是政府的问题。呵呵
二、党组织关系档案补办是有一定难度。不知道你是在大学入的党，还是高中阶段入的党？如果是高中入党的，那问题好解决，但如果是在大学入党的，你要跑一趟可能有些困难。
三、你毕业时把组织关系迁移证交给谁，建议你找该同志再仔细找找。因为责任在她，她应该无条件帮你补办党关系档案。当然，如果她在村/居委会给你补办，那是太容易了，但你不能答应。因为走过的路程不同，入党性质不同。你必须要求她按照原来的样子一一给你落实。
祝你好运！

把档案迁回家了？是否留有当地人才中心的缴费证明或接收证明或其他证明你档案交给他们的证据？如果有复印一下复印件将原件留好那这些材料与人才中心谈。不行的话可以咨询一下当地法律援助中心看是否可以诉诸法律。

烧个香，告诉毛主席吧