省纪委驻教育厅纪检组好还市发改委好？

两个单位都不错，看你的性格、爱好更适合哪个单位，这需要你自己判断。我不知道你是怎么进这两个单位的，所以有些情况不好分析。
省教育厅纪检组工资福利在教育厅，人事编制在省纪委，也就是说你是省纪委的人，可以和其他纪检组以及省纪委机关内部处室来回轮岗，还是不错的，特别对哪些不喜欢长期在一个单位呆下去的。
市发改委也不错，但是还要看具体处室。你自己衡量一下吧。

最有实权的当然是发改委，不过关键看您在哪块比较擅长或比较有关系。