注册税务师进行审计应遵守哪个法规或是准则？

ssueeq的回答是错误的。
注册税务师的税务审核并不是依据《中国注册会计师审计准则》，而是依据政府已颁布的各种税（费）法律、法规、规章及相关规定，国家税总局及各级税务机关发布的税收法律法规。
目前注册税务师的业务准则还不是很完整，只有所得税汇算清缴鉴证准则及损失税前扣除鉴证准则两个具体准则，其余的准则尚处于制定过程中。
至于注册税务师相关的专业法律法规，目前尚未发布成文法但国家也在制定当中，估计明年将会出台注册税务师管理条例。

中国注册会计师审计准则