是不是分数线越高的军校毕业分到部队的待遇越高？

不是，所有的军校毕业到部队的工资待遇是一样的。国防生也是。
部队的工资是看级别的，级别一样工资就一样，不看你毕业自哪里。
比如中尉，国防科大毕业的中尉，跟一个一般的军校的中尉工资是一样的。 清华的国防生跟广东工业大学的国防生毕业入伍后工资也是一样的。

不同的只是兵种和地区的差异，但是不会太大。

满分毕业和及格毕业待遇是一样的，只是以后的发展可能不一样，如出成绩、提拔等。