关于DNA序列在NCBI上比对的问题

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/06/21 23:10:26
1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?
2.请大概说一下,我想知道是什么菌,应该怎样使用NCBI,越详细越好。
万分感谢!

正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了。

把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自什么菌种(不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了),并且查阅提交这个序列的相关文献。得到进一步的信息。
我说的步骤,只要你认真看NCBI的网页,你自己应该是可以操作下去的。

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如果你嫌麻烦,序列发给我,我帮你做好了。

如果你想知道具体的,我嫌打字麻烦 - -|||

而且,专业鉴定是不直接上NCBI对比的,你只是想知道是什么菌的话也根本不用测两端,测一端就够了。

同意楼上,测序都测过了,让你老板教教你!