报表中母公司营业利润为负，而合并后为正

并不是说明利润输送情况。

而是说明被合并范围内的子公司存在很强的盈利情况。

子公司的盈利足以弥补母公司的亏损。

合并报表是反映集团公司的整体盈利能力的，也就是母公司与所有子公司在一定期间的盈利能力。但这并不代表母公司做为一个个体的盈利能力。

合并报表是反映集团公司的整体财务状况\经营成果\现金流量的财务报表,合并利润表就是母公司与所有子公司在一定期间的盈利相加,再抵减内部未实现交易,内部相互投资算重的部分后合并而成,你说的这种情况,母公司亏损,并不代表集团财务报表就应是亏损.他的子公司如果是盈利很大,然后集团公司就会盈利,这是正常的.
对上市公司股东没有直接的什么影响,在不存在财务报表舞弊的情况下，这样的财务报表是真实的企业获利能力的反映，当然对于后期准备处置这样获利良好的子公司，影响就大啦．