作用场所在细胞内的蛋白质

内质网上的核糖体合成的蛋白质，会运送到高尔基体进一步加工，作用场所为细胞膜上或者细胞外，例如胃蛋白酶原、胰岛素；细胞质中核糖体合成的蛋白质，作用场所一般在细胞内，例如葡萄糖激酶、核酸内切酶

一,如果一段mRNA的序列上有信号肽序列，信号肽可使正在翻译的核糖体附着到糙面内质网膜上。
在信号肽指引下蛋白质在细胞内的输运
核糖体是通过信号肽的功能而附着并合成分泌蛋白的。因此游离的核糖体和膜结合核糖体之间本身并无差异。信号肽是作为一种附着到ER膜上的信号识别，此可能通过开始合成出的N-端头几个氨基酸的疏水功能。然后蛋白链插进膜中，信号肽埋在膜中的一种蛋白酶所剪切这时核糖体已完成翻译，蛋白已沿着信号肽途经穿过膜。

这些来到内质网膜腔内的蛋白质，在这里被后续加工和折叠，然后出泡运输到高尔基体，被糖基化修饰后再次出泡，运输到细胞膜上，运输小泡膜和细胞膜融合，这些蛋白被释放到细胞外，或是嵌入膜中。

例子...留在膜上的有CD4,CD8这种信号分子和Na-K离子通道;分泌出来的如胶原蛋白,血红蛋白等等

二,如果一个蛋白质没有信号肽序列，在核糖体起始翻译后不会插入内质网，那么他就继续翻译下去，在胞质溶胶中完成翻译折叠和修饰，最后留在细胞质中。

这些蛋白的去向分为两类,一类的序列里有一个"导肽",这个氨基酸序列引导它进入线粒体或是叶绿体(植物)，如线粒体外膜蛋白P70。另一类就是简单地留在细胞质中,如微管蛋白。