为什么在中原王朝没有政教合一这种现象

这是因为华夏文明的革命性和普遍性决定的。
世界四大文明古国中，很多是利用教来同一人心的，而华夏文明在世界范围内是最活跃、最革命的，特别是春秋战国时期，百花齐放百家争鸣，在哲学思想上有各种唯物主义和辩证法出现。也许在我国古代比仰韶文化更久远的时代也有政教合一的小部族出现，但是总的来说，是政大于教。
另外，我国有史以来一直和黄河、淮河、长江的洪水做斗争，夏禹王的政绩远比巫师神汉要让人民叹服，这也是一个很重要的因素。

没有？有吧，只是不完全而以！看看唐朝李世民干了什么

儒家思想统治了中国几千年了，现在不还是。