请各位帮帮忙,我们公司给客户开了增值税发票,但他们放了三个月以后过期了没法认证了

没关系的，这种情况是经常发生的。你们将退回的发票做作废处理，向税务局申报，经审批之后在当月开红字发票冲掉就可以了。
另外，尽量不要告诉税务局是因为发票过期所以作废的，很多地方不允许在这种情况下重开，可以解释为交易变更，所以发票重开等。

就是因为已经交过税金了，所以才必须先向税务局备案，经过税务局同意，才能作废该发票并开红字发票冲掉相应的税金，如果你们已经缴纳了税金，开红字发票，就相当于从本月税金当中扣除掉相应的税金，这样才能完整的处理这个事情，企业没有多交税金，税务部门手续也都办理齐全了。

1、下次在开错增殖税专用发票的时候,最好别开负数,最好的办法是发票作废.
2、他三个月都没抵是他的事情啊！与我们无关。
3、退回来的那张发票也不用做销项负数，可以根据以前的税额具体的调一下就行了。