辅导期已过，但认证相符的进项税还有没有抵扣的，想问一下应该怎么将它抵扣完，是否可以再辅导期候抵扣？

可以继续抵扣的，最好问一下你的税务专管员

辅导期是当月认证下月抵扣，转为正式一般纳税人后是当月认证当月抵扣。
也就是说，你刚转正的第一个月的进项税是两个月的，即上月认证本月抵扣的和本月认证本月抵扣的。
帐务处理上是一样的。

增值税票是一样的.一般都是上月认证后,后一个是一定可以抵扣的.不过运费发票就不一样了.因为它也是待抵扣进项税额.但它比对时间比较长.可能是一个月,也可能是二个月.所以,你就是转正后,也一定要等到督核结果通知单下来后.你才可以和正常的企业一样.不然你必须一直等抵扣(我指的是运费).增值税不存在呀