引物设计时3'端最后一个碱基为什么不能是A

引物设计时3′端不能选择A，最好选择T，是因为引物3′端错配时，不同碱基引发效率存在着很大的差异，当末位的碱基为A时，即使在错配的情况下，也能有引发链的合成，而当末位链为T时，错配的引发效率大大降低，G、C错配的引发效率介于A、T之间，所以3′端最好选择T。 它的理由只是讲如果存在错配并且引物的3‘末端是A的话，使错配链延伸的几率要比末端是T/C/G时大得多，仅仅是一个几率的问题，能不能肯定的说就会比末端是T/C/G时大呢，个人觉得未必。