购货的增值税发票未抵扣，和其同步的运输发票也不允许抵扣么？

1、因为运费发票不需要认证，但是有的地区如山东省要求，必须在申报时使用专门的采集软件录入抵扣信息，随申报资料一并报送税务机关。之后才能按运费金额的7％的扣除率计算进项税额准予抵扣。
2、如果你所在的地区没有这个要求，你就可以先于包装箱发票之前进行抵扣的帐务处理：
借：销售费用－包装箱运费4，650
借：应交税金－应交增值税（进项税额）350
贷：货币资金（现金或银行存款）5，000
以上特此回答！

从2007年1月1日起公路、内河运输发票通过税控系统开具，同增值税专用发票一样经过认证后才能抵扣，其认证和抵扣的时限也同增值税专用发票一样。因此增值税专用发票和运输发票开具的时间应该是一样的，应该和增值税专用发票一样也超过了90天的认证抵扣期，不过如果运输发票开具日期滞后与专用发票几天，而没有超过90天，抓紧认证，还是能够抵扣的。

你是增值税一般纳税人是可以抵扣的：3400+5000*7%=3750

你的例子反而把我给弄糊涂了。
不过我可以告诉你，你买一批货物，这个时候你收到了对方开具的专用发票，以及运输发票，他们的认证不受双方的限制，我的意思也就是说，在你没有认证销售货物开具的专用发票是你也是可以认证运输发票的，月底抵扣的时候，你就只能抵扣运输发票的那个进项而已

从2007年1月1日起公路运输发票一定要认证才能抵扣，增值税专用发票与运输发票不一定要同步认证。
一般的普通发票（无密码区的）是不能抵扣，