日语里做为两个分句之间的停顿会用到が，那别人会不会听成表示疑问句的结尾词か呢

“が”在句末表示轻微的转折，但有的人用“が”好象是种爱好。
因为“が”无论在什么位置都不会读成疑问的上升调，所以不会与“か”混淆。

有可能 但是是日本人就不会了 人家自己也根据意思有个猜测 要是日语不好的人听了 就会出问题了 容易搞错

如果是日本人.就不会.
不过你最好用标准音去读,而不是读成 GA

其实完全没必要担心，这个が往往出现在句尾。根据上下文来判断什么意思的。