现在是不是有一部分学校的研究生自主招生了 这会不会影响其公平性，具体有哪些学校

研究生招生本质上是高校自主招生。因此，不存在你的说法。其实，你或许是问教育部门自主划线的大学。研究生招生里，有教育部三十四所大学是研究生招生的自主划线单位，这并不影响其公平性，因为只是划线不依照国家线而已。
具体的学校，你可以去查看。
北京大学
清华大学
上海交通大学
大连理工大学
中国科学技术大学

山东大学
复旦大学
中国人民大学
北京航空航天大学
北京理工大学

天津大学
南开大学
中国农业大学
北京师范大学
哈尔滨工业大学

吉林大学
同济大学
南京大学
华中科技大学
西安交通大学

东北大学
东南大学
浙江大学
华南理工大学
西北工业大学

厦门大学
湖南大学
武汉大学
兰州大学
电子科技大学

中山大学
中南大学
重庆大学
四川大学