民事诉讼怎么进行

首先要确定下你所说的赔偿是何种赔偿？
民事赔偿?刑事附带民事赔偿?工伤赔偿等等!

不同的法律关系,诉讼程序也是不一样的.
民事、刑事及行政诉讼都有自己的程序和相关的步骤。

单就起诉而言，简单归纳几点：

一、要有明确的被告、及相关证据（包括书证，人证等等）。
二、没有超过诉讼时效，在现行法律保护的范围之内。
三、明确管辖法院是否有管辖权。

上法院提交起诉状，法院审查合理就会受理

去法院立案庭，他们会告诉能不能立案，或者要准备一些什么材料的。
建议你先找个律师咨询一下。
是什么赔偿协商啊？找消协、找劳动部门？……