申请做商检 和 申请报关（出关单）需要是同一家公司吗？（急）

都可以
外贸中代表货物的这套单证，最基本的就是发票（Invoice）、装箱单（PackingList）和提单（BillofLoading）。这三种单证,是提货报关的基础。其中最重要的是提单，因为它是提货证明，法律上的“物权凭证”，由国际海洋运输的正规船公司出具（或货物运输代理人出具，简称货代提单），一般是三正三副，任何一份正本都可以提货，而一旦提了货，其余两份正本就失效了。发票和装箱单主要是用于说明货物情况，比如数量、价值等，格式也较为随意，只要包含相关内容就行。可以自己在电脑上用WORD来自己制作发票和装箱单，签字盖章即可。
商检证、原产地证和普惠制证这些单证，一般由出口生产厂家（已在商检局备案）来申办，或有进出口权的公司申办。不过有时候，是工厂申办而经由外贸公司出口的。这就会出现单证抬头与实际出口人抬头（显示在出口商业发票、装箱单与提单上）不一致的情况。在信用证操作模式下，会有一点争议和麻烦。首先，信用证上就不能规定“不接受第三方单据”字样。或者保险起见，干脆要求客户在信用证上明确表示“接受第三方单证”，以免银行在审核信用证单据的时候对此有异议

可以的,但是B公司报关一般不接这样的活,一般都商检报关一起做

你是说，通关单上的发货人写A公司，然后B公司提供报关单据？那么公司名称不就不符了了吗？

你的意思是这样吗 : A是工厂 B是外贸公司 由工厂做商检 外贸公司报关 ？ 可以的 不过你要先咨询一下当地的商检局 具体的流程