房屋买卖时契税做好了，中介方说这样就有保障了，房产证肯定能做出来可以付全款了，请问这样做可以吗。

契税和房产证是同时办理的，中介并没有骗你。
北京像海淀区就是当天过户当天拿证。我们朝阳就是要一个月。
而且你可以打电话给当地的房管局咨询。

契税是你签订房屋买卖合同所要缴纳的税。取得房屋所有权是以办理过户手续后取得房地产权证为准。俩者没有必然关系。只是取得房地产权证前必须缴纳契税。
至于如何付款是由双方合同约定，和缴税、办理产证也并不一定有必然关系。
但为保险起见，至少要等到过户当日付清房款。既然你没有按揭，就可要求过户，如没有其他条件制约下。
具体解决方案还是要看具体合同的约定。